La Fundación UNPA cuenta con un Consejo de Administración responsable de acompañar la gestión institucional, promover sus objetivos y fortalecer la vinculación entre la Universidad Nacional de la Patagonia Austral, la comunidad, el Estado y el sector productivo.

Presidente:
Ing. Héctor Aníbal Billoni

Vicepresidenta:
AdeS Eugenia Márquez

Secretaria:
Prof. Evangelina Claverie

Tesorero:
M.M.O. Rodolfo Pallero

Pro Tesorero:
Ing. Roberto Sardi

Vocales:
1° Prof. Marta Ambos